Η έκθεση «Σταυροφορίες: Μύθος και πραγματικότητα» αναδεικνύει τις αλληλεπιδράσεις που αναπτύχθηκαν μεταξύ των πολιτισμών της Ευρώπης, της Ανατολικής Μεσογείου και της Μέσης Ανατολής, καλύπτοντας 8 αιώνες ιστορίας και μύθων: από την Α' Σταυροφορία, τέλη του 11ου αιώνα, όταν οι πρώτοι σταυροφόροι ξεκίνησαν από την Ευρώπη να κατακτήσουν την Ανατολή, έως και το 18ο αιώνα, όταν ο Ναπολέων κατέκτησε τη Μάλτα και εκδίωξε τα τελευταία μέλη του Τάγματος των Ιπποτών του Αγίου Ιωάννη, που ιδρύθηκε στην Ιερουσαλήμ στη διάρκεια των σταυροφοριών.

Η έκθεση αναπτύσσεται σε 6 θεματικές ενότητες, προσπαθώντας να καλύψει την ιστορία και την κληρονομιά των σταυροφοριών:

• θρησκεία και διαμόρφωση νοοτροπιών
• το Τάγμα των Ιπποτών του Αγίου Ιωάννη
• οι στρατιωτικές πτυχές των σταυροφοριών
• σύμβολο εξουσίας
• εμπόριο, οικονομία και αστική ζωή
• ισλαμική παρουσία στη Δύση

Στην ανάδειξη του γενικότερου ιστορικού πλαισίου συμβάλλει και το πολυμεσικό διαδραστικό έκθεμα, που προβάλλεται ταυτόχρονα στους χώρους της έκθεσης.